跡地ですが、以下なお店とのことです。(公式サイト様より引用)

子供から大人まで楽しめる「つくるんです®️」が、JR秋葉原駅 昭和通り口(日比谷線乗換口)みどりの窓口跡に期間限定ポップアップショップOPEN!

場所:JR秋葉原駅 昭和通り口(日比谷線乗換口)みどりの窓口跡
期間:8/19〜31
時間:10:30〜20:00(最終日は18:00まで)